TRP-1 |
| General Information |
| Protegen ID |
1360 |
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Sequence Strain (Species/Organism) |
Mus musculus |
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Taxonomy ID |
10090
|
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Molecule Role |
Protective antigen |
| Related Vaccines(s) |
B16 melanoma DNA vaccine pSin-mTRP-1
,
Melanoma recombinant vector vaccine rVVmTRP-1 encoding TRP-1
,
Recombinant Vaccinia-TRP1 Vaccine
,
TRP1(0RF3):1-9 Peptide Vaccine
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| References |
|
| Gene Information |
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Gene Name |
TRP-1 |
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NCBI Gene ID |
22178
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Genbank Accession |
AF087673 |
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Chromosome No |
4 |
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Locus Tag |
RP23-372M15.1 |
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Gene Starting Position |
80834207 |
|
Gene Ending Position |
80851735 |
|
DNA Sequence |
>NC_000070.6:80834207-80851735 Mus musculus strain C57BL/6J chromosome 4, GRCm38.p4 C57BL/6J
GTGTGAGAAGGGATTAGTGAGAGCTGGAAGAGAGGACCAGCCCCTCCCAGTGTGAGGAATCTGGCTTGGG
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TATAAAAGCAGCCATGTTGATTAGTTACAACAAATCACATGACATTATAAACAAATAGAATCCTGATTAT
CTTTCTGAAACTGCTCTCATTTTGCTTTCAGCGTATTATTTGGCCTCAGGTGCAAGGCCACCACAAAGTC
ACAGTCCTTGCCACACATGGTAAAGACGAAAGCTTCACTTGCTGGAACACATCTGCTCTTGCATATTTGC
CAATGTGTTCCCTAGCTCAGTTCTCTGGACATGAAACTGCCTGGGCCACAGTTCACCTCTAATTCTCGTA
TCTTAGAGGCCTGCGAGGAAGGTATCAGTCAGAGGACACAATGTTCTGTGCATCTTATCAAATGTTGTAT
TTCATTTCAACAGCATTGTTACACCACTTATCAGCCTTCTGTGTATTTCAAAATAAATATAATAAAATCT
TCTTTCATTGGTTCCAGGTTTTCAAAAAT
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| Protein Information |
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Protein Name |
transcript variant X1 |
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NCBI Protein GI |
530537244
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Protein Accession |
NP_001268943 |
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Protein pI |
5.94 |
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Protein Weight |
57188.15 |
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Protein Length |
537 |
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Protein Note |
Also known as b; isa; TRP1; Tyrp; TRP-1; brown |
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Protein Sequence |
>NP_001268943.1 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase precursor [Mus musculus]
MKSYNVLPLAYISLFLMLFYQVWAQFPRECANIEALRRGVCCPDLLPSSGPGTDPCGSSSGRGRCVAVIA
DSRPHSRHYPHDGKDDREAWPLRFFNRTCQCNDNFSGHNCGTCRPGWRGAACNQKILTVRRNLLDLSPEE
KSHFVRALDMAKRTTHPQFVIATRRLEDILGPDGNTPQFENISVYNYFVWTHYYSVKKTFLGTGQESFGD
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SVFSQWRVVCESLEEYDTLGTLCNSTEGGPIRRNPAGNVGRPAVQRLPEPQDVTQCLEVRVFDTPPFYSN
STDSFRNTVEGYSAPTGKYDPAVRSLHNLAHLFLNGTGGQTHLSPNDPIFVLLHTFTDAVFDEWLRRYNA
DISTFPLENAPIGHNRQYNMVPFWPPVTNTEMFVTAPDNLGYAYEVQWPGQEFTVSEIITIAVVAALLLV
AAIFGVASCLIRSRSTKNEANQPLLTDHYQRYAEDYEELPNPNHSMV
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| Epitope Information |
| IEDB Linear Epitope |
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| IEDB ID |
Epitope |
Starting position |
Ending position |
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MKSYNVLPLAYISLFLMLFYQVWAQFPRECANIEALRRGVCCPDLLPSSGPGTDPCGSSSGRGRCVAVIADSRPHSRHYPHDGKDDREAWPLRFFNRTCQCNDNFSGHNCGTCRPGWRGAACNQKILTVRRNLLDLSPEEKSHFVRALDMAKRTTHPQFVIATRRLEDILGPDGNTPQFENISVYNYFVWTHYYSVKKTFLGTGQESFGDVDFSHEGPAFLTWHRYHLLQLERDMQEMLQEPSFSLPYWNFATGKNVCDVCTDDLMGSRSNFDSTLISPNSVFSQWRVVCESLEEYDTLGTLCNSTEGGPIRRNPAGNVGRPAVQRLPEPQDVTQCLEVRVFDTPPFYSNSTDSFRNTVEGYSAPTGKYDPAVRSLHNLAHLFLNGTGGQTHLSPNDPIFVLLHTFTDAVFDEWLRRYNADISTFPLENAPIGHNRQYNMVPFWPPVTNTEMFVTAPDNLGYAYEVQWPGQEFTVSEIITIAVVAALLLVAAIFGVASCLIRSRSTKNEANQPLLTDHYQRYAEDYEELPNPNHSMV
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