EPCAM |
| General Information |
| Protegen ID |
317 |
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Sequence Strain (Species/Organism) |
Homo sapiens |
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Taxonomy ID |
9606
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Molecule Role |
Protective antigen |
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Molecule Role Annotation |
The full-length GA733 (epcam) antigen expressed by recombinant adenovirus inhibited the growth of established tumors in mice (Maruyama et al., 2000). |
| Related Vaccines(s) |
Cancer EPCAM protein vaccine
,
KSA-KLH Conjugate Vaccine
,
L612 HuMAb
,
Recombinant Colorectal cancer antigen GA733 Vaccine
|
| References |
Maruyama et al., 2000: Maruyama H, Zaloudik J, Li W, Sperlagh M, Koido T, Somasundaram R, Scheck S, Prewett M, Herlyn D. Cancer vaccines: single-epitope anti-idiotype vaccine versus multiple-epitope antigen vaccine. Cancer immunology, immunotherapy : CII. 2000; 49(3); 123-132. [PubMed: 10881691].
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| Gene Information |
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Gene Name |
EPCAM |
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NCBI Gene ID |
4072
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Genbank Accession |
AC079775 |
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Chromosome No |
2 |
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Gene Starting Position |
47369147 |
|
Gene Ending Position |
47387027 |
|
DNA Sequence |
>NC_000002.12:47369147-47387027 Homo sapiens chromosome 2, GRCh38.p12 Primary Assembly
CAACTGCAGCGCCGGGGCTGGGGGAGGGGAGCCTACTCACTCCCCCAACTCCCGGGCGGTGACTCATCAA
CGAGCACCAGCGGCCAGAGGTGAGCAGTCCCGGGAAGGGGCCGAGAGGCGGGGCCGCCAGGTCGGGCAGG
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GGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACGTGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTATCCGGGC
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CACTCCACCAGGCTGGCCATATTGCCCAGCTGTGTGAGGGTGGCATGTCCAGAGCACAGTAGTAGGAAAG
GCGTTGGGCAGTGTATCCATTTTCAAAGACATTTACATATTTAAAAATACAAAAAAGTAAACTCCCAAGA
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AGAATGACAACAGGTAGGGATAGACAGTTAATAGAAATTTCAGATGGCAAATGAACACAAGTGGTTAATG
CTGGAAGTCTAATTGTTCTGTAGAAATAAATGAAAACACAAGTGCAATAAGGAAGCACATTGTTATTGTA
TCATAGCATTGCTTGTAAAGGTGAATCTGGCCAGGCGTGGTGGCTTACGCCTATAATCCCAGCACTTTGG
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TCTCTACTAAAAATACAAAATGAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTCATTCTGGCTACTCAGGAGGCT
GAGGCAGGAGAGTCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCATGTCATTGCACTCCA
GCCTGGGCAACGAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAATGAATAAAAACAACAACAAAAGTGAATCTGGAAA
ATAGCCTGAGTGTGTATCAGTAAGAGAGTAAATTATGTTTATTGTATCTACGATAGGGAATAATGTGAAT
GGTGAATGAGTTCGATCTTTATCTTTGGATCTGGAATGGTTGCTATGATGTTGATACAAGCTGTGCACAG
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TGTATTAGTGTGGAAAAGGAGGATGTGGAAGAATGCACACCAAACTGTTAAATTTCTTTCTTTTTTTTTT
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AATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGA
CAGAGCGAGACTCCATCTGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGGAGTCTCTCTGTGTTGCCCTGGCTGGAGT
GCAGTGTCATGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCACCTGCCGGGTTCAATTGATTCTCCTGCCTCACCCTC
CCGAGTAGCCGGGACTACATGCAGAAGCCACCATGTCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGG
GTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCATCACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCTCAAAG
TGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
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CTCTTTCTTTTCTGTTGTCCCATTGGATCCAGCATTGTTTTTGATTTTGATTTTTGTTTGTTTGTTTCAC
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GGGATTACAGGCGACCACCACCGCGCCTGGCTAATTTTTTTGTTTTTTTAGTAGAGTCGGGGGGTTTCAT
CATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCACCTCGGCCCCACAAAGTACCG
GTGAGCCACCACGCCCAGCCCACCTTATTTATTTTTAAGAGACAGGGTCTTACTCTGTAGCCCAGGCTGG
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CTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGTGCCATGACACCTGGCTAATTTTTGTATTTGTAGTAGAGATG
GGGTTTCACCGTGTTGGCTGGGCTGGTCTGAAACTCCTGACCTCAGATGATCTTCCCGCTTCGGCCTCCC
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TTATGGATAGATGTTAAAATTAGTTTTTTTTCAGATCAAAATTATGTCCATTAAAAGCATATATGTCTGT
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CCATGGCAGATCACCATCTGTTTTCTGCCTCATAGAAGAGTGGAATGGGAAGCCTATGGTTTTTATTCTA
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CTTGGAATTGAATATGAACACTTATCCTTGAACCCTATCAATAACATTTTTCACATATCTCAATTTTTGT
GTGTCTTTGTAGTTGTATGTGGGCCACTTACTAATATTTTAGCAAGTAATAAAAATAGAAACGTAAAGGA
ATATTGGAAAAAGTCTAATGGAACCAGAAAGTTCTAGCATTTTTTTCCCATTCTGTAGTAGGTCATCTGG
TTTATTTGGTTTGGTGACCGCAAGTCTAGAAGACTAACCCTGAATTGAATGGTAACAGACAGGCAGAATG
ACAATGTAGTGTTGCAGTGCAGAGCAGTACAGACCTGGGTTTGGCTGGGCAAAATTATATAACTTCTTTA
AGCCTCCATGTTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATAATAGATAGTATGGACCTGTTGCAAGGATTAAACAT
AATCAGTGTAAAGTGTTGGTCCCATGCTTGCCACATAAGAAAATATTTGTCAACAGAGTGGTAGTTGTCA
TTATCATTGTCTCAGTTTGCCTGTAACTAGTTGTGTGATCTGAGACAAACACTAATTTTGAACTTGAGTT
TCCCCACATGTAAAATGAAAGATTGATAATAGAAAGTAAATCAATTTTTTCTAGCATTAAAAATAGTATG
CATTTAATAAAAATCTTATTCTTAATGATCTAGCTTACCTCCAACTTGCCCTAGTCACTTTGGCGATCTT
GTCTCTAAATAGAACCTTGAAAACACTTAAATGTGTGTTTCCTTGCAATATAACTTTTTCTTTTTTTATT
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GGAGATGGGTGAGATGCATAGGGAACTCAATGCATAACTATATAATTTGAAGATTATAGAAGAAGGGAAA
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CAATCTTGAAATTTGACCACAAGTGTCTTATATATGCAGATCTAATGTAAAATCCAGAACTTGGACTCCA
TCGTTAAAATTATTTATGTGTAACATTCAAATGTGTGCATTAAATATGCTTCCACAGTAAAATCTGAAAA
ACTGATTTGTGATTGAAAGCTGCCTTTCTATTTACTTGAGTCTTGTACATACATACTTTTTTATGAGCTA
TGAAATAAAACATTTTAAACTGAATTTCTTA
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| Protein Information |
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Protein Name |
epithelial cell adhesion molecule |
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NCBI Protein GI |
218505670
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Protein Accession |
NP_002345 |
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Protein pI |
7.53 |
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Protein Weight |
32154.08 |
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Protein Length |
314 |
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Protein Note |
Also known as ESA; KSA; M4S1; MK-1; DIAR5; EGP-2; EGP40; KS1/4; MIC18; TROP1; EGP314; HNPCC8; GA733-2; TACSTD1 |
|
Protein Sequence |
>NP_002345.2 epithelial cell adhesion molecule precursor [Homo sapiens]
MAPPQVLAFGLLLAAATATFAAAQEECVCENYKLAVNCFVNNNRQCQCTSVGAQNTVICSKLAAKCLVMK
AEMNGSKLGRRAKPEGALQNNDGLYDPDCDESGLFKAKQCNGTSMCWCVNTAGVRRTDKDTEITCSERVR
TYWIIIELKHKAREKPYDSKSLRTALQKEITTRYQLDPKFITSILYENNVITIDLVQNSSQKTQNDVDIA
DVAYYFEKDVKGESLFHSKKMDLTVNGEQLDLDPGQTLIYYVDEKAPEFSMQGLKAGVIAVIVVVVIAVV
AGIVVLVISRKKRMAKYEKAEIKEMGEMHRELNA
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| Epitope Information |
| IEDB Linear Epitope |
|
| IEDB ID |
Epitope |
MHC restriction |
Starting position |
Ending position |
| 923951 |
VRTYWIIIELKHKAREKPYDSKSLRTALQKEIT |
HLA class I |
139 |
172 |
| IEDB ID |
Epitope |
Starting position |
Ending position |
|
|
|
MAPPQVLAFGLLLAAATATFAAAQEECVCENYKLAVNCFVNNNRQCQCTSVGAQNTVICSKLAAKCLVMKAEMNGSKLGRRAKPEGALQNNDGLYDPDCDESGLFKAKQCNGTSMCWCVNTAGVRRTDKDTEITCSERVRTYWIIIELKHKAREKPYDSKSLRTALQKEITTRYQLDPKFITSILYENNVITIDLVQNSSQKTQNDVDIADVAYYFEKDVKGESLFHSKKMDLTVNGEQLDLDPGQTLIYYVDEKAPEFSMQGLKAGVIAVIVVVVIAVVAGIVVLVISRKKRMAKYEKAEIKEMGEMHRELNA
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