ARMC10 |
| General Information |
| Protegen ID |
3614 |
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Sequence Strain (Species/Organism) |
Homo sapiens |
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Taxonomy ID |
9606
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Molecule Role |
Protective antigen |
| Related Vaccines(s) |
FluMist
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| References |
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| Gene Information |
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Gene Name |
ARMC10 |
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NCBI Gene ID |
83787
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Genbank Accession |
AC007683 |
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Chromosome No |
7 |
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Gene Starting Position |
103074880 |
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Gene Ending Position |
103099772 |
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DNA Sequence |
>NC_000007.14:103074880-103099772 Homo sapiens chromosome 7, GRCh38.p12 Primary Assembly
CACCGCCCCGCGCTCCGCTGCCAGGGGCGGGAGGGAGGAATGGTTGCTTCACGCCCCGGGGGAAGAGACG
GGAAGCTCGGCTCTGGGTTGCGGGCCCCGGCGTCTCCGCGTGGGGCGCACCGTCCGACCCCCCCCTCCCG
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TCTAGCAATATTGCACCATTCCCAGGCAGTTTCCAACGTGCATCAGCATGTCTGTCTCCAGTGGAACAAG
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CAGGCTGAGTTCAGCCAGGCAAGTCTGGCCTTGGGGCTGTATATATCTGTCTCAGACATCGTCTGTGTTT
TCATATATTTTTTGACTTTTTAAAAGATGACCCAGACCACAATAGTATGTTCTATTTTTGTTTTGTTGTG
TTGTGTTTTTCCATTACATTGCTTAGTACAGTATTTCTAGGATAGAAAATTTGCTTTCTTGGTCTGCCTT
GGAACATACCTACCAATTACAACATTGATTTTCCATAAAAATTGAGTTTAAAGTTCCAACTTGCAAATGA
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GGTACACCACTGATTGATAACTTAATGCAGATAGTGGAGGATTAACATAAACTGTGTGCTTGTTACATCC
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AAAAACATGTCTTAATATGGTTTCAAACCAAAATCCATATATTTGTTTAATCTGTAGTTGTACTCTAACT
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GATTTTGACTTCATCCAGGCTTATTTCGTAAGTTCAGGACCATCCTATTTCATACCTCCTGTTCCTATTT
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CTCTTTTTTGACACAGAATCTCACTCTGTTGCCCAGGCTAGATTGCAGTGGCATGATCTCTGCTCACTGC
AGCCTTGAGCTTCCAGGCTCAAACAATCCTCCTACCTCAGCCTCCCTGGGACTTTGGTCACATGCCACCA
CGCCTGGCTGATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGCCCATGTTGCTCTTGAACTC
CTGAGCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAATGCAGGCATGCGCCACCGCACCT
GGCCAAAAATACCAACACTTAATCGTGATCATTTCTGGTTATGTAAATACGGGTAAATTTTCTTTTTCTT
TGTGGTTTTCTATTTTTTTGAAAGTGCTATGGTAAACATCTGTTGCCTTTGTAATAAAAAATTTTTCTAA
AATAATATCCAGGTTCCTTCCCAGCTCTAGTGAAGAGCACATTTGTCCCATTTCCCTGAGTTAGTACCCC
CCTCTATGCTTATTTTAGTTCCAGGTATCTTGTAGAAAGTATGGTTTCACATGGCCTTTGTTTTTAAAAG
ACTTGGAACCAACCCGAATGTCCAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGG
AATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGACAAAATTGGAAATCAT
CATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACTGTATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGA
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GGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGTGCACCAGCATGG
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GGCTCATTGCCTGTAATCCTAGTTACTTTGGGAGGCCAAAGTGAGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCA
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TGCTTATTTATATGATTGTAAAACACTTTCACATTAAAAGATAACCTCAAAAATTCATGGTAGCTTACCA
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CGGGGGTGAAGATGGGGTCTAAGGGTCTCACTATATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTGTTCACAGGC
ACAATCATAGCTTACTACATCCTTGAACTTGAACATCCTTGAGATGGGAAGGCTCAAGAGATCCTCCCCC
GCTCAGCTTCCCAAGTACCTAGGACTACAGGCCGACACCATCATGCCTGGCCATACTTCACTTACCAGTA
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GGTAGATTGTGAAGACATTTGCAATATTCTATCTCCCTGACATTATAATTGGGAAAAATTAGGTTTAAAT
AACCGTGTGATAGAAAACCTGTATCTCTGTGATAAGTTCTCTAAGAGTGGTACAAGACATTTGCAATATT
CTCTCTATCTCCCTAACGATGTAATTGGAAAAATGAGGTTTAAATAACACTGTTCTATGATAGGTTCTCT
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TGGAGTAGAGAGAATTTGAGCCAGGCCTGGAAGCTTAGGCAGGACTTTAACAGGAAGACATGGTGAGAGA
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CAAGTTTTGAAACTGCTTTTGAATTTGTCTGAAAATCCAGCCATGACAGAAGGACTTCTCCGTGCCCAAG
TAAATAGCTTATATATTTATTTTGTAAATATACACATATATACATTTGAACAGACAGACAGATCTGGAAA
GATTAAGCCTAAAATGTTAACAGGGATTCTCTCTGAGGAGCAGTATTAAAGGTGGTTTTTTAAATTCATT
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TTATACTTGAACTGTTTGTGTTTACATGTATCTTAGTATCCACTGAAACAGCAGTACTGAGTCCCCAGCA
TATGCTAGATGAGACACACCAGTGAGCACAGCGTGACATGGTACATGTCCTCACGAAGCTTACAGTCTAG
TGGAGAGACAAAAATATATAACAAGTGAACAAGGTAATTAAAAGCTGTGATAAGTGTTCTGAATGCTGGG
ATAGAATGGAGCTCCACTCCTGTAGAAGAGGAACCATCGTATTCATCTGCTCATCCCTATTCCCCACCCA
GCTCTGTGCCCTGTGGTGTATGGGCACTAAATGTTTGATGAAAAAATGAGTTCCCATGAAAACCGTATGA
TGATCTTAAAAAAGAAAATGGTTGTTTTTCCCAAATAACCACATTCTAAAATTCCAAGGAAATTGTATTT
TTCCAGCTGAAACACTCCCTTTTTTCCATTAGTATTACAGCGTGGGGGTACATAAGGTTTTATACATCTA
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TCCTTATAAGGGGATTCTCCCAGCTGCTAAATTTAAACAGTAAATATCACATTTTGTCATTAACACAGCT
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TTGAGGCCATTCACCTGCCAACCTGACCATACTGCTTTCAAAAGTCTTTTCTCATCAGTAGAATCTATTT
TGGTCACTTCTAGTCAATGAAAAATGTAAACTTTTAGGAGAGAATGTTTCTTAGGACTCACCCACTCCAT
TCAATGTTATATATAAAATAGTGTGATCAATCACAATGTCCATCTTTAGACAGTTGGTTAAATAAATTAT
CTGGTCTTTGAAAAGACCGTGCTGGGCGCGGTGGCTCTTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAG
GCGGGCAGATCACCTGAGATCGGGAGTTTGAGACCAAGCCTGACCAATATGGAGAAACCCTGTCTCTACT
AAGAACACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGG
AGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGC
AACAAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATGATGGAGCTCCGAATGTGCTTAAGTGGAAAGA
TATCTATGAAATATGGTGGTTTTTTAAAACACAAAAATTATAGAATATGGGATCCCGTGTGTGTGTGTGT
GTGTTTGAATGAAAAATGCTTATGTATTGACAGAACACTTCTAGAATGATACCCAAACTCCTGGAGTGGG
AGTGGGGAATGCCTTCTACGTACACACTGTTCTACTGTTTGAATTTTTTAATATGAGCCCAAATTGTATA
ATCTTTTTTTAATAAAGGGGAGAAAAATCACTTACAAGGTTAT
|
| Protein Information |
|
Protein Name |
transcript variant A |
|
NCBI Protein GI |
238776793
|
|
Protein Accession |
NP_001154481 |
|
Protein pI |
6.79 |
|
Protein Weight |
31666.74 |
|
Protein Length |
308 |
|
Protein Note |
Also known as SVH; PNAS112; PNAS-112; PSEC 0198 |
|
Protein Sequence |
>NP_001154481.1 armadillo repeat-containing protein 10 isoform b [Homo sapiens]
MGGPRGAGWVAAGLLLGAGACYCIYRLTRGRRRGDRELGIRSSKSAEDLTDGSYDDVLNAEQLQKLLYLL
ESTEDPVIIERALITLGNNAAFSVNQAIIRELGGIPIVANKINHSNQSIKEKALNALNNLSVNVENQIKI
KIYISQVCEDVFSGPLNSAVQLAGLTLLTNMTVTNDHQHMLHSYITDLFQVLLTGNGNTKVQVLKLLLNL
SENPAMTEGLLRAQVDSSFLSLYDSHVAKEILLRVLTLFQNIKNCLKIEGHLAVQPTFTEGSLFFLLHGE
ECAQKIRALVDHHDAEVKEKVVTIIPKI
|
| Epitope Information |
| IEDB Linear Epitope |
|
| IEDB ID |
Epitope |
MHC restriction |
Starting position |
Ending position |
| IEDB ID |
Epitope |
Starting position |
Ending position |
|
|
|
MGGPRGAGWVAAGLLLGAGACYCIYRLTRGRRRGDRELGIRSSKSAEDLTDGSYDDVLNAEQLQKLLYLLESTEDPVIIERALITLGNNAAFSVNQAIIRELGGIPIVANKINHSNQSIKEKALNALNNLSVNVENQIKIKIYISQVCEDVFSGPLNSAVQLAGLTLLTNMTVTNDHQHMLHSYITDLFQVLLTGNGNTKVQVLKLLLNLSENPAMTEGLLRAQVDSSFLSLYDSHVAKEILLRVLTLFQNIKNCLKIEGHLAVQPTFTEGSLFFLLHGEECAQKIRALVDHHDAEVKEKVVTIIPKI
|