COPB2 |
| General Information |
| Protegen ID |
3692 |
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Sequence Strain (Species/Organism) |
Homo sapiens |
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Taxonomy ID |
9606
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Molecule Role |
Protective antigen |
| Related Vaccines(s) |
FluMist
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| References |
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| Gene Information |
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Gene Name |
COPB2 |
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NCBI Gene ID |
9276
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Genbank Accession |
AC024933 |
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Chromosome No |
3 |
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Gene Starting Position |
139355594 |
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Gene Ending Position |
139389679 |
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DNA Sequence |
>NC_000003.12:139355594-139389679 Homo sapiens chromosome 3, GRCh38.p12 Primary Assembly
ATTTAGTTTGAAGTTGGCACACACTTTTATAGGACTGTGAATCAAATGAAGAAAACCCCTAGATAACATT
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AATGGATCAAAGTTATCCAATTTGGGTAAAATCACCTGCCCTTCAGGTACCTACTAGAGCAGCTCAATAG
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TTCTCCCACTTGAGCCTCCCTGAACAGCTCATTTAGCTCAAACATTTAGATAGATGTGCTAAGGGCATCC
CTTGCTGAAGGTGAGTGCCACCAAGGCAGCACTGTCCTGTTCTGACTGCCCCGTCTATTCAACACCATTT
GGCCATTCATCAGTTCTCTCCAGGGTTCATTCTTCACTTCCCTCTCCAAAAACCATCCTCAGTGTAGAAT
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CATCTCTCTCCGCACCCTCTGCTAGCTTGTTCACCATATTAGCATTTCCAGAGGCAGTGGCCAAAAGCAG
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AGCACTGTCCTTCTCTGACTGCCTGCTCTATTCAACACCAAAAGATGAGGGGGTTGGGCTGTCTTTCAAA
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GGGAAAACTTTAATAACAAAACATTACACCAAACACATAGAAGTACCTACTGACTTTTCCATCAGTTATG
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ACACATATACAGTGTACACACATTCACAGAGCAAATCATTTCCCTCTCAAACTAGAAACCCCACTATTTA
ATAAGAAGATGGAATAATTAAGGAGTCATTAAAGGAAGTGGTAAGAACAAACCTGGCAGATAAAATATTC
AGTGACAGAATTCTTACTGTTTATTAGGATAATGGAAGCTGGCTAATGTTAAACTCAAGTAACCAGTAAA
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CAAAAGACAGGAAGTCTAAAATTTCCTTCCCATGCTCCATTAAGGCATTAAGAACAAGCTTTTAAACCAG
GGGTCTCCCAAACAACCAGTCTGTGGCCTGTTAGGAATCAGGCCGCACAGCAGAGGGTGAGCAGTGGGTG
GGTGGGTGAGTGAGCATTACCGCCTAAACTCCGCCTGTAACGGCATTAGATTCTCATAGGAGCATGAACC
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TGAGGTGGAACAGTTTCATCCTGAAATGTACCCCCTTCCCATCTGTGGAAAAATTGTCTATCTGCCACGA
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ATGAGTTACGATTTTAATTTTTCACATTTCACCAGAAATCCTTAAATGCTGTCTCCCTACACCTAATTTA
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GGATATGACAAACTGCACATACTTGGTTTCTTACAACATTTACCTTCTTATATCAAGATGATAAGTATTC
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CAGTAGCCTATTCCCTCTTGCTCTAGAACAGTGTTTATCACCTTTTTTATTTTTTTCATTTTCACCCACC
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GACAGTGAAAACTGTCAAAGCAGCGGGCAGTTCTAAAGGTAAACACTTTGTCACTGGAGATGGTCACCTC
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AGTTCTACCAAATGTTGGAAATATCTTCAAATATTTTTCAGTAATTATGCAAAAATATAAAATAAATATT
TGAAGATTATCTGATGTACTGTTTTCCTAAGAGATCAGAGAACTCCTTACAGTTGGACAAATGATGAAAG
GGTTTTATACTGTGTATGACATGAATTACTAGGGCTTACAAACCACTTTAGAAACTGAAAATGACCCAAA
TGTCCACAATAGGTGAATGATTAAACAAATTATCGTATATTCATATAATGGAATGCTACTCTGCAAATAA
AGAAACCAATTACTGATCCAGGCAAGAATATGGATGAATCTCAAAAACATTATACTGAACAAAAGATGCT
GGACTCAAGAGTACATACTGTATGATTCCATTTATATGAAACTCCAAAGACAACTCTAATCTATATAGTG
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GGATCGCTGTACAATTAAGTGGTACATTCTGTCTTCTGTAAATTATACCTCAATAAGGGCGATTTAAATA
ATAAAAACTGTGACAAATGGTTCATTAATCAGCCATCATCAGCAACAACTGCTTATATTCAGGCCTCTGC
CTTGAAAAAAGGAGCTGTGGCTATCACTGGATATTTAAGATTGTCTGAGGAAGTGATGTGATGAGGGCTT
TGCTCAGGACAGGAAAGATGCTGAGCAAGGTCTTGGCTGGATAGAGCTGAAAAAAAGGACTATCAAAATA
GAGGAAGAGGTGTGCTGAGAGAAGGCAATTCATCAACTATAATTTTGCTTAAGATAACACATTACCTTTG
AATACATAGAACTGTATGTATATGTGTATTTAGGAAATTTATGAAAATATCAGAACAATTCCATACCTCT
CAATAAATCTTACTGTTGTAACATTTTAAAAAATGTATCTTATTACACAACGCTGAGGCTTAAGTTACCC
CACTGTTGGGGGCAAGATGCAACATAAAATGTGGGGCAAACAAAACTAAAAAAACTGTGAAAATGTAATT
CAGTTGTGTGGTCTGAAAACACTAAACCCCTAATGTTTATTACGTGCATTAAACAGGAATCAAAAAGGAA
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AAAAGATTTAATAAATTTCTCATCAAAATGATCAAACCACAACATCACTCCCAAGTAGCTCATAAAGGGG
CAGTAGCACCTCAGGACACTACATCACAGGGAGGGCATGCCAAGGCCTGCCAAGGCAGACATGAGGGTCT
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GCTCATGCTATACACTCGCCTCTGACTCTCATCTTCCAATGGACAGCTCTGGTGAGAACTGTTTTTTAAC
ACGGAGAATCACAGCCCACATCAAGCCTTGAGAGTCTTCAAGCAGCACACAACACATCTGCAATCAGGGC
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TTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGACCTCGGCTCACTG
CAGCCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCC
CGCCACCACGCCCGGCTAATTTCTTTTTTTTTTTTTTGCATTTTCAATAGAGACGGAAGATATTCTTATA
CTATCGTTTTCTTTCCTTATTATTATAACACTCTTGTGCAAACTAGTCTAGGGCGTTTTTTAGGGTTACG
GTGATAATAACAAAGTGCTCTAACAATTACTATTCTTACCAGCCACTGGATTTGCAAATGCATAAAAGCA
CACCAGCCAGTGTTATAAACAGCACCCCCTTCCTCCCAACCCTTCTTCTCCCCTTAGAAACCTAACAGCT
GAGATATCAAAGCATTTGAAATTCCATTTTTGACTCCATATACATTTGTTTTTGGCTTCTTTGCTTGTTT
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CCCTCAGTCCAGAAGCTCCAGGAATCGGCCGTAACCTATGGGACCCCGCTCCCTTCTACGGGATCTGGAC
CTACCATGGCTGCGTCGGTCCAATCCCGGGAACCCTCGTTTGTTACCGGCTACTCAGGCCTTGAGATAAA
CCCACCGATCCACTGACCGTCAGACTGACTGACGTGGAACTTCCGGGAGCCGATTCTCGCGATAGT
|
| Protein Information |
|
Protein Name |
transcript variant X1 |
|
NCBI Protein GI |
4758032
|
|
Protein Accession |
NP_004757 |
|
Protein pI |
4.93 |
|
Protein Weight |
96036.93 |
|
Protein Length |
906 |
|
Protein Note |
Also known as beta'-COP |
|
Protein Sequence |
>NP_004757.1 coatomer subunit beta' [Homo sapiens]
MPLRLDIKRKLTARSDRVKSVDLHPTEPWMLASLYNGSVCVWNHETQTLVKTFEVCDLPVRAAKFVARKN
WVVTGADDMQIRVFNYNTLERVHMFEAHSDYIRCIAVHPTQPFILTSSDDMLIKLWDWDKKWSCSQVFEG
HTHYVMQIVINPKDNNQFASASLDRTIKVWQLGSSSPNFTLEGHEKGVNCIDYYSGGDKPYLISGADDRL
VKIWDYQNKTCVQTLEGHAQNVSCASFHPELPIIITGSEDGTVRIWHSSTYRLESTLNYGMERVWCVASL
RGSNNVALGYDEGSIIVKLGREEPAMSMDANGKIIWAKHSEVQQANLKAMGDAEIKDGERLPLAVKDMGS
CEIYPQTIQHNPNGRFVVVCGDGEYIIYTAMALRNKSFGSAQEFAWAHDSSEYAIRESNSIVKIFKNFKE
KKSFKPDFGAESIYGGFLLGVRSVNGLAFYDWDNTELIRRIEIQPKHIFWSDSGELVCIATEESFFILKY
LSEKVLAAQETHEGVTEDGIEDAFEVLGEIQEIVKTGLWVGDCFIYTSSVNRLNYYVGGEIVTIAHLDRT
MYLLGYIPKDNRLYLGDKELNIISYSLLVSVLEYQTAVMRRDFSMADKVLPTIPKEQRTRVAHFLEKQGF
KQQALTVSTDPEHRFELALQLGELKIAYQLAVEAESEQKWKQLAELAISKCQFGLAQECLHHAQDYGGLL
LLATASGNANMVNKLAEGAERDGKNNVAFMSYFLQGKVDACLELLIRTGRLPEAAFLARTYLPSQVSRVV
KLWRENLSKVNQKAAESLADPTEYENLFPGLKEAFVVEEWVKETHADLWPAKQYPLVTPNEERNVMEEGK
DFQPSRSTAQQELDGKPASPTPVIVASHTANKEEKSLLELEVDLDNLELEDIDTTDINLDEDILDD
|
| Epitope Information |
| IEDB Linear Epitope |
|
| IEDB ID |
Epitope |
MHC restriction |
Starting position |
Ending position |
| IEDB ID |
Epitope |
Starting position |
Ending position |
|
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