GGPS1 |
| General Information |
| Protegen ID |
3695 |
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Sequence Strain (Species/Organism) |
Homo sapiens |
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Taxonomy ID |
9606
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Molecule Role |
Protective antigen |
| Related Vaccines(s) |
FluMist
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| References |
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| Gene Information |
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Gene Name |
GGPS1 |
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NCBI Gene ID |
9453
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Genbank Accession |
AL391994 |
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Chromosome No |
1 |
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Gene Starting Position |
235328437 |
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Gene Ending Position |
235344531 |
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DNA Sequence |
>NC_000001.11:235328437-235344531 Homo sapiens chromosome 1, GRCh38.p12 Primary Assembly
ACGCGCAAATCCTCGTCCGCGAGAACTGCAAGGCCCGCAATGCCCTGCGCCTGCGTGGACCGGTGCGGGG
GCGGGGGGGAGGTGAAAGGGGCGGGGCAACAAAGCAGTAGGGAGGCGGCAACGACGCCTGCGCAGTGTGA
CCGGGATGGCGCATTTTCTTGCACCAACTAATGCGGTGTCGCTGGCGGCTGAGGAGGGCGGAGAGTTCTG
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CAGGACTTTTAGGGGGTCCATCACCCATGTAATCACGTTGTACCCATTAAGTAATCTTTCATCATCCACC
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GGTAAGGGCTATCCATCCATTTTGCTGCAAATGACATGATTTCATTTTGTTTTAATGGCTGAGTAATCAT
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TTACTATTGTGAATAGTGCTGTAATAAACACATAGTGCAAGATTTTGGAAATTTTACTTTTGTGGCACGT
TGTTGGTATTTACTCAGGATCTTTGGATTTGCTTGGCTGCATGTATATGAATCAGTGTGTTTATTTACTG
AAATATGTGCAAAAGTCTTGTCTTTGGTGGATTAATTTATAATATAAATCCACAAAAGTCAGATTCTGCT
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GAGAGTATCAATGATCAGATCATAGTATCAGGTGACTGGGCTATAGAAGATGACTTTTATTACTTAACAT
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GAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGA
GACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAACACATCCTCACTGTTACAATAAATAACAGTA
GCCCACACCCCCTTAGTTGTGATGTGGTGTGATACCATGTAAGCAACCTATTTCCAGTTCCCCTAACATT
CTCAAGCAGCTGTATCAGAATCATACAAGATGCATATTTAAATTGAAGATTTCTAAGTCTCTGGCCCAGA
CTTAGAAAAAAAGGATCAGGCCGGGCACAGTAGCTAACACCTGCAATTCCAACACTTTGGGAGGCTGAGG
CGGGTGGATCGCCTGAGGTCAGGAGTTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACCCCATCTCTACTA
AAAATTCAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCAAGAACCTGTAATCCCTGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAG
GGGAATCACTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGG
CAACGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAACAAAAGGACCTTTGAGCAATCAGAATAACACAAAGTA
CATGAACTGAACTTCATTTTCTTCATTCAAAAGAAAGTGGCCCTCACTCAAGCAAATATATTCTTGTGCT
TTATCTTCTGGCATACTGAGATAACTTTCTAAAGTGGTTTCCAATTCCAAAATCCAATGATGTGCAACTC
ATTGAACAGCCCTAACCACAAACTGCCATTAGATGCCATATTACATTTAGCCTTTTTGTTGTAGAAAAGT
TGGTTAGAAGTGGGCTCAGGATTCTAAAGACTAAATCATAGTCCCAAGAAGCAAAAGAAAGAGGATAAAA
GTAATAAACTTCCCAAAATGTGCCAAAGATGCTAGAGCAGTTAGATTCCTAATATGAGGACAAGTAATAA
TAGAAACAGATACAAAGAAATAAAGTAGAGATTCAACAGTACAGGGAGACCCTAGGAAGACCATGAGTGT
TATTCTAGGAAATACTGAAATAAGACAGATTTCAGTATAAAGGGGAATATGTTTAATAAATATATGCATT
TGAGTTAATGCGTATTTTAAATCAGAAATCTCTGAAATGGATTGATTGTAGAGAAACTACTAGGGGGACG
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TTACTAATTAGTGTAATCAGTTAAATACAGAGGTATCTTTCCAATTCTTTGGATGTGTTTTGACATTTGC
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CATCACAATTTAATTTTATAACATTTTGATCCCTGCGAAAAGAAACCCTGTACTCATTAGCAATTAGTCC
CTGTTCCTAACCACTAATCTACTTTCTTTCTCTGTAGATTGGCTTATTCTGAACATTTCGTATAAATGGA
ATCATACAATATGTAGTCTCTTGAGATTGGCTTCTTTCACTTAACATGTTTTCAAGGCTTCATAGCTGTA
GAATCTTGCTTTGTTTTTTTGAGACTGGAGTCACTCTTTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTC
AGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCCAGAACT
ACAGGCACACACCACCATGCTCGGCTAATCTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGTGTGAAGGCTGGTCTCGA
ACTCCTGACCTCATGATCTACCCACCTCAGCTAATTTTTCATATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTTGCCAT
GTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTTAAGCTATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGA
TTACAGGCGTGAACTACCGTGCCCAGCAACAGAATCTTCTTTTTAAACCAGACTAGGTGTCTTTTCACAA
ACACCCTGCAATACAAATTCCTTTGCAGTTTGACACTGAAAGATGATTAGTTTCATGTGATCTTTATGTT
TCTCCTTTTTGACAGATTAGCTTTGAAGTTTAAATCCAATGGAGAAGACTCAAGAAACAGTCCAAAGAAT
TCTTCTAGAACCCTATAAATACTTACTTCAGTTACCAGGTAATACTTCACTTACAGTCCATATAGGGTCA
TTTTCATGCAGTAGTGGTCGTTCAAATGTTAGCAAATAGAAAAGGTTAGACTTGCTAGCCGTTGAGATTT
TCTATTTAAGGTGATGCGTATGAGAAAAATGATAAATAGAACATTATAATTTTTTCTTTATTAAAAGGTA
ATTTTTGCCAGGTGCAGTGATACATACCTGTTGTCCCACCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCT
TGAGCCCAGGAGTTTAAGGCTATAGTGCACAATGATCACACCTGTGAATAGCCACTACACTCCAGCTTGG
GCAACATAGTGAGACCCCGTCTCTTAAAAAGAAACGTAATTTTTGAAGGCACCCTTTAAAACATATCCAA
TTATTTAACATATCTTGAAAAATAAAAATACTTAAAACATTTTGGTATCTCATTGGAGGTTGTACTCTTT
ACGGATATTACGCATTCAGATTCCCCACTGTTTAGATATTAGGGGAAGTTACGCAGATTTGTTTAACAGT
AGAACACTTTATTTACCATACATGTTCAAGTTTACCTTCTATGTCTGTATTTTCCAGTATCTCACACATA
CACTGCATTTCATATACTACTGGTTCCTTTGAGAGCCAAATAATAATGTATCTAAAATCACAGTATTTGG
AAATATAGCCCACTTTATTCCTGTATAAGGGTATGCCACCTTGGACATGGCTTCCTACCTCACGTGTACG
TGTGTGTTTTTGTTTTATTTTGCTTCTTTAAAAACTTGTCTGGAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGT
AATCCCAGCACTTTTTGAGGCCAAGGCGGGCGGATCATGAGGTCAAGAGGTTGAGACCAGCCTGGCCAAC
ATGGTAAAACCCCGTCTCTACTAAAAACACAAAAGTTAGCTGGGCATGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCA
GCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACCTGAACCTGGAAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTG
CATCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAATGAGACTCCGACTCAAAAAAAAAGAAGAACTTGTCTGGAAA
TGATAATAAGCAAAAACTCATGAATATAATAAACAGGGGTTATTGTAATAAAAAATCATTTGTATTAGAA
TATTCTTTCTCATAGACATAATATAGGCCAGGTGTGGTGGCCCACACCTGTATTCCCAGCACTTTGGGAA
GCCAAGGCAGGATTGCTTGAGACCAAAAGTTTGAGACCACCTTGGGCAACATAACAAGTCCCCCTCTCTG
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ATTTAGCCATACTGTGACTAAACTCTAATGATGCTCTCAATTCAGTCTCAATAGACACTTTTAAATTTCC
GTGCTAAAGTACACACCTTTCTTTATGAGCACTTCTCTGTGGTAATATGTGCATTTCTGTTCTTCATGAG
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TGACTTCCTTTTTTTTAATTCTCATTACTTGGAAATAATGTTTTAAGACATTAGATAACATATTTAAAAT
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AAATTAGCTGGATTTAGTGGCGCACGACTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCT
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CTGGCCAACATAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAATTACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCT
GTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGGGGCGGAGGTTGCAGTGAG
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ATCATTCCTTTGTATGTGACTACAATGACTTCTAGTGGTAACTTCTATCCAAAGACCTATCTTAAATTAG
CCACGCATGGTGGCACATGCGTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGATCTT
GGGAGGCGGAGGTTGCAAGTGAGCCGAGATCACGCCGCTGCAATCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGACTC
CGTCTCAAAAACAAAAAACAAAAAGACCTATCTTGAGCTTTCCGTGTAAGAAAAAGATGATACTGTTGGG
TGAAGTGACTCAACGTCTGTAATTTCAGCAATTTGGGAGGCTGTAGCGGCCGGATTGCTTGAGCCCAGGA
GTTTGAGACCAGCTTGGGCAACATGGGAACACACTGTCTCTACAAAAACAAAAATTAACCGGGCGTGGTC
GCTTGCACCTATAGTGCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCTGTGAACACACCACT
GCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAGCAAGAAGCGCAGTGGCTCACGC
CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGC
TAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATGAGCCGGGCGTGGTAGCGGGCGCCTGTAG
TCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGA
GATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AACAAGAAAGAAAAAAAGAAGATACTGAAAAATAGATGTCCCTAGTCAAAATAATGAGATTAGCTTTTGA
CTAAACTCAGGATATTAAAAGGGAATACTTCAGTGCATGATGATCTCATTTTTGAAAGGAAAGAAGCAGA
GCTTCCCCATCTCTAAAACCTTAATTCAAAGGAGAAATAGATAATTTCAAGAGGTATTTTTATGAGGTAA
TAGTAAAATATATTTTATTAACAGTACCTATAGTTATGTAAAATAGGTAGTGCCAATTAACTGACACTAA
ACTAGCTTCTTGGCCTGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAACACTTTGGGAGGCCGATGCGGGTGT
ATCGCTTGGGCTCAGGAATTCAAGGCCAGCCTGGGCAACATATTAAAACCCCCTTTCTATAAAATATACA
AAAATTAGCCAGGCATGGTGTGTGCCTGTAGTCCCAGATACTCAGGAGGCTGAGGCACGAGAATCATGTG
AACCCAGGAGGTGGAGTTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAA
ACTCTGTCTCAAATAATTAATAAATAAACTAGCTTCCTTTTCAAAAAAAGAAATAAATTAGGTCCTAAGT
CCTAAAAGCCCATCCTACTTTAAAATTGTTTATTCAAGTTCAGATGAAAAGAGTGGACTAGTAGGCAACT
GAAGTGCTTTAGAGTCTCCCGTGCCTGCCCTAATTTTAGAAGGTTGTGCACTTTATGATCCAGATTTCTG
AGTGGTTGAGAATGAGTTATTGAGCAGTGCAAGGCAAGCTCTGCAGTAGGTAATGGATTGATGAGGCTGG
ATTTAGCAAGTCTGATCAATCTAAAGGAAGTTTCTGAATGTGTTTTTTGTAGTTAAAATACTCATAATTA
AAACACTTATCACATTGTCACATTTTATTTTTAAATTGCAGGTAAACAAGTGAGAACCAAACTTTCACAG
GCATTTAATCATTGGCTGAAAGTTCCAGAGGACAAGCTACAGGTATTAGGCAACTCTAACCTCATTAATC
CCCAAGAAATTAATAGCTGTCGCATAAAAATATTCCTAGTTCTTGATTGAATTTAGTCCTCATGCAAGAT
ATTATTTTATATTGAGGTTGCTAAATATTTATTAGTTGTGAAAATTAACACACCTGAGACTTTCATAATC
TGTTAATTAAACTGAGTAAGTTTTGAATAGTTCAAATAAGTGAAATTTTCAATTTTTTTATTAGATTATT
ATTGAAGTGACAGAAATGTTGCATAATGCCAGTTTACTCATCGATGATATTGAAGACAACTCAAAACTCC
GACGTGGCTTTCCAGTGGCCCACAGCATCTATGGAATCCCATCTGTCATCAATTCTGCCAATTACGTGTA
TTTCCTTGGCTTGGAGAAAGTCTTAACCCTTGATCACCCAGATGCAGTGAAGCTTTTTACCCGCCAGCTT
TTGGAACTCCATCAGGGACAAGGCCTAGATATTTACTGGAGGGATAATTACACTTGTCCCACTGAAGAAG
AATATAAAGCTATGGTGCTGCAGAAAACAGGTGGACTGTTTGGATTAGCAGTAGGTCTCATGCAGTTGTT
CTCTGATTACAAAGAAGATTTAAAACCGCTACTTAATACACTTGGGCTCTTTTTCCAAATTAGGGATGAT
TATGCTAATCTACACTCCAAAGAATATAGTGAAAACAAAAGTTTTTGTGAAGATCTGACAGAGGGAAAGT
TCTCATTTCCTACTATTCATGCTATTTGGTCAAGGCCTGAAAGCACCCAGGTGCAGAATATCTTGCGCCA
GAGAACAGAAAACATAGATATAAAAAAATACTGTGTACATTATCTTGAGGATGTAGGTTCTTTTGAATAC
ACTCGTAATACCCTTAAAGAGCTTGAAGCTAAAGCCTATAAACAGATTGATGCACGTGGTGGGAACCCTG
AGCTAGTAGCCTTAGTAAAACACTTAAGTAAGATGTTCAAAGAAGAAAATGAATAATGTTAAGCCATTCT
TGATTGGACCTCATAGCTTATTTTAGTTAATCTTTTTTTTGTCTTTTAGCCTTACCACCTTTTAAAAAAT
TTGTTATTCTCCAGAAACAGTAAATAGGTGAGTAGGGGTGGTGCAAGTGAATTCGTTTTCATTTAGAAGC
CCCTCTGTACAGATAATCAAAATTCAAAGTTGAAAGAATCAAAAGCAGCCACAGTTATGTAGGTCTGATT
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AAGGAATATCTCACTTTTCCCCCCGGAAACACCCTCACTGAAGTCTTCTATGAAAAGGCTGATAATGGGC
TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGG
AGATCGAGACCATCCTGACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGT
GGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCAGGAGGCGGAG
CTTGCAGTGAGCCGAGATAGTGCCTCTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAA
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CACCCCACAAGTTTTGCTTTTTAACCAAGGTGTCTCTGCTTGATGAAATTCACATGCTAGTCTAAATCTT
TTTTTCTCCCTTGTAACATTTATGTGCCCCAAACTGGTTAGTATATGGGTACAGCATTCCCTTTCCAATT
GGGAAGCGGAAAAAGAGAGTATGGGATATTTTAGAAGGGAGCCTTTGAACCTTATTATATTTCCCCATCA
TTGATAGTGACAATCTTAAAAGGGTTGTTTTCTTACCTTAAGTACAAAAGCATGGAAAAATGCGCTTTTC
CTTCCCGCCCACATCACCACCCCGACTTGAAGACAGTAGGTGCTTGAATGGAAAGTGAGTAGGCATCTTT
AATCGCCCTGATTAAAGGAAAGTGTTAGCCTGAGAGGGCCTGACTGAAAAGTAACCAAAGGCTTAATATC
AAACACTAATTAGCTTTTTAGTGCCTTAACCCTGACCTGGTTACCAGTTTTCTGTAGTTTCTACACCCAA
GCCACTGAAGTCATCTGTGGCCCAAGAGGTAGGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTGATTTCAATATTT
GATTTGTTGACATCCCAAAATGAAAGTTTTATGTTTCCCTTAGAAACATGTTTTGCTTGGTTCTATAGTA
TGTTACTTAGGATCTATTTACCATATATTTGTATGAGAAATCCTCACCCAAGCATTCAACCTAAATCTTT
GAAAAGTTGGGTGCTGTCTTTAGTAACTTTTAAAATAGTTTAAATCTCCCATTTTAATAGTGATAAGGAA
ACCTGTTAAAATCATGGCTATTGATGTTATAGTATGGAAAGTTGAACTTTATGAACCCATACTTTTAAAA
AGCATTTTTAAAAATCTAACACTGACTATAGAAACAAATTAAAATGTCTACCTTTAAGTATAAAA
|
| Protein Information |
|
Protein Name |
transcript variant 2 |
|
NCBI Protein GI |
83700220
|
|
Protein Accession |
NP_001032354 |
|
Protein pI |
6.06 |
|
Protein Weight |
33282.65 |
|
Protein Length |
300 |
|
Protein Note |
Also known as GGPPS; GGPPS1 |
|
Protein Sequence |
>NP_001032354.1 geranylgeranyl pyrophosphate synthase [Homo sapiens]
MEKTQETVQRILLEPYKYLLQLPGKQVRTKLSQAFNHWLKVPEDKLQIIIEVTEMLHNASLLIDDIEDNS
KLRRGFPVAHSIYGIPSVINSANYVYFLGLEKVLTLDHPDAVKLFTRQLLELHQGQGLDIYWRDNYTCPT
EEEYKAMVLQKTGGLFGLAVGLMQLFSDYKEDLKPLLNTLGLFFQIRDDYANLHSKEYSENKSFCEDLTE
GKFSFPTIHAIWSRPESTQVQNILRQRTENIDIKKYCVHYLEDVGSFEYTRNTLKELEAKAYKQIDARGG
NPELVALVKHLSKMFKEENE
|
| Epitope Information |
| IEDB Linear Epitope |
|
| IEDB ID |
Epitope |
MHC restriction |
Starting position |
Ending position |
| IEDB ID |
Epitope |
Starting position |
Ending position |
|
|
|
MEKTQETVQRILLEPYKYLLQLPGKQVRTKLSQAFNHWLKVPEDKLQIIIEVTEMLHNASLLIDDIEDNSKLRRGFPVAHSIYGIPSVINSANYVYFLGLEKVLTLDHPDAVKLFTRQLLELHQGQGLDIYWRDNYTCPTEEEYKAMVLQKTGGLFGLAVGLMQLFSDYKEDLKPLLNTLGLFFQIRDDYANLHSKEYSENKSFCEDLTEGKFSFPTIHAIWSRPESTQVQNILRQRTENIDIKKYCVHYLEDVGSFEYTRNTLKELEAKAYKQIDARGGNPELVALVKHLSKMFKEENE
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