sdrD
General Information
Protegen ID
4184
Sequence Strain (Species/Organism)
Staphylococcus aureus
Taxonomy ID
426430
Other Database IDs
CDD:309682IPR001899 IPR003367 IPR005877 IPR008454 IPR008966 O86488
Molecule Role
Protective antigen
Molecule Role Annotation
(Rauch et al. , 2014 )
References
Rauch et al. , 2014: Rauch S, Gough P, Kim HK, Schneewind O, Missiakas D. Vaccine protection of leukopenic mice against Staphylococcus aureus bloodstream infection. Infection and immunity . 2014; 82(11); 4889-4898. [PubMed: 25183728 ].
Gene Information
Gene Name
sdrD
Protein Information
Protein Name
SdrD
NCBI Protein GI
CAA06651
Protein pI
4.04
Protein Weight
134390.88
Protein Length
1376
Protein Note
YSIRK type signal peptide; pfam04650
Protein Sequence
>CAA06651.1 sdrD [Staphylococcus aureus]
MLNRENKTAITRKGMVSNRLNKFSIRKYTVGTASILVGTTLIFGLGNQEAKAAESTNKELNEATTSASDN
QSSDKVDMQQLNQEDNTKNDNQKEMVSSQGNETTSNGNKLIEKESVQSTTGNKVEVSTAKSDEQASPKST
NEDLNTKQTISNQEALQPDLQENKSVVNVQPTNEENKKVDAKTESTTLNVKSDAIKSNDETLVDNNSNSN
NENNADIILPKSTAPKRLNTRMRIAAVQPSSTEAKNVNDLITSNTTLTVVDADKNNKIVPAQDYLSLKSQ
ITVDDKVKSGDYFTIKYSDTVQVYGLNPEDIKNIGDIKDPNNGETIATAKHDTANNLITYTFTDYVDRFN
SVQMGINYSIYMDADTIPVSKNDVEFNVTIGNTTTKTTANIQYPDYVVNEKNSIGSAFTETVSHVGNKEN
PGYYKQTIYVNPSENSLTNAKLKVQAYHSSYPNNIGQINKDVTDIKIYQVPKGYTLNKGYDVNTKELTDV
TNQYLQKITYGDNNSAVIDFGNADSAYVVMVNTKFQYTNSESPTLVQMATLSSTGNKSVSTGNALGFTNN
QSGGAGQEVYKIGNYVWEDTNKNGVQELGEKGVGNVTVTVFDNNTNTKVGEAVTKEDGSYLIPNLPNGDY
RVEFSNLPKGYEVTPSKQGNNEELDSNGLSSVITVNGKDNLSADLGIYKPKYNLGDYVWEDTNKNGIQDQ
DEKGISGVTVTLKDENGNVLKTVTTDADGKYKFTDLDNGNYKVEFTTPEGYTPTTVTSGSDIEKDSNGLT
TTGVINGADNMTLDSGFYKTPKYNLGNYVWEDTNKDGKQDSTEKGISGVTVTLKNENGEVLQTTKTDKDG
KYQFTGLENGTYKVEFETPSGYTPTQVGSGTDEGIDSNGTSTTGVIKDKDNDTIDSGFYKPTYNLGDYVW
EDTNKNGVQDKDEKGISGVTVTLKDENDKVLKTVTTDENGKYQFTDLNNGTYKVEFETPSGYTPTSVTSG
NDTEKDSNGLTTTGVIKDADNMTLDSGFYKTPKYSLGDYVWYDSNKDGKQDSTEKGIKDVKVTLLNEKGE
VIGTTKTDENGKYCFDNLDSGKYKVIFEKPAGLTQTGTNTTEDDKDADGGEVDVTITDHDDFTLDNGYYE
EETSDSDSDSDSDSDSDRDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDRDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDAGKHT
PVKPMSTTKDHHNKAKALPETGNENSGSNNATLFGGLFAALGSLLLFGRRKKQNK
Epitope Information
IEDB Linear Epitope
-- Assay Type --
T Cell Epitope
B Cell Epitope
IEDB ID
Epitope
MHC restriction
Starting position
Ending position
IEDB ID
Epitope
Starting position
Ending position
MLNRENKTAITRKGMVSNRLNKFSIRKYTVGTASILVGTTLIFGLGNQEAKAAESTNKELNEATTSASDNQSSDKVDMQQLNQEDNTKNDNQKEMVSSQGNETTSNGNKLIEKESVQSTTGNKVEVSTAKSDEQASPKSTNEDLNTKQTISNQEALQPDLQENKSVVNVQPTNEENKKVDAKTESTTLNVKSDAIKSNDETLVDNNSNSNNENNADIILPKSTAPKRLNTRMRIAAVQPSSTEAKNVNDLITSNTTLTVVDADKNNKIVPAQDYLSLKSQITVDDKVKSGDYFTIKYSDTVQVYGLNPEDIKNIGDIKDPNNGETIATAKHDTANNLITYTFTDYVDRFNSVQMGINYSIYMDADTIPVSKNDVEFNVTIGNTTTKTTANIQYPDYVVNEKNSIGSAFTETVSHVGNKENPGYYKQTIYVNPSENSLTNAKLKVQAYHSSYPNNIGQINKDVTDIKIYQVPKGYTLNKGYDVNTKELTDVTNQYLQKITYGDNNSAVIDFGNADSAYVVMVNTKFQYTNSESPTLVQMATLSSTGNKSVSTGNALGFTNNQSGGAGQEVYKIGNYVWEDTNKNGVQELGEKGVGNVTVTVFDNNTNTKVGEAVTKEDGSYLIPNLPNGDYRVEFSNLPKGYEVTPSKQGNNEELDSNGLSSVITVNGKDNLSADLGIYKPKYNLGDYVWEDTNKNGIQDQDEKGISGVTVTLKDENGNVLKTVTTDADGKYKFTDLDNGNYKVEFTTPEGYTPTTVTSGSDIEKDSNGLTTTGVINGADNMTLDSGFYKTPKYNLGNYVWEDTNKDGKQDSTEKGISGVTVTLKNENGEVLQTTKTDKDGKYQFTGLENGTYKVEFETPSGYTPTQVGSGTDEGIDSNGTSTTGVIKDKDNDTIDSGFYKPTYNLGDYVWEDTNKNGVQDKDEKGISGVTVTLKDENDKVLKTVTTDENGKYQFTDLNNGTYKVEFETPSGYTPTSVTSGNDTEKDSNGLTTTGVIKDADNMTLDSGFYKTPKYSLGDYVWYDSNKDGKQDSTEKGIKDVKVTLLNEKGEVIGTTKTDENGKYCFDNLDSGKYKVIFEKPAGLTQTGTNTTEDDKDADGGEVDVTITDHDDFTLDNGYYEEETSDSDSDSDSDSDSDRDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDRDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDAGKHTPVKPMSTTKDHHNKAKALPETGNENSGSNNATLFGGLFAALGSLLLFGRRKKQNK
