ligB |
| General Information |
| Protegen ID |
1650 |
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Sequence Strain (Species/Organism) |
Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 |
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Taxonomy ID |
267671
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Molecule Role |
Protective antigen |
| Related Vaccines(s) |
Leptospira interrogans DNA vaccine pTARGET/ LigBrep
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| References |
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| Gene Information |
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Gene Name |
ligB |
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NCBI Gene ID |
2771118
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Genbank Accession |
AE016823 |
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Chromosome No |
I |
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Locus Tag |
LIC10464 |
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Gene Starting Position |
526394 |
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Gene Ending Position |
532066 |
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DNA Sequence |
>NC_005823.1:526394-532066 Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130, chromosome I, complete sequence
ATTATTGATTCTGTTGTCTGTAAATTTTGACCGGTTTATTTTTGTTTCCTACGCTTATATATACGAAATT
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GAATTGAGTTAAGAATGGCTGGTGTAACGGTAATTTTTTGTTCAGAGTATAGGCCGTTGTATTCTGCTTT
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GGGACGATGGATGTCAAATCCGTAATATTCTGATTTGTTCCGTTATCAAAGATTGCGGTAACTTCTAGGG
TTGTACTGGTACCGTTTGCGATAGAAGAATCTTGATAACTAAGTTCGATTCTTGTAATAGTCGGATTGAA
GTTACCTAACAGAAGGTGGAAAAAGGACAGCCCATTACTTTTTTTACCAGCGGTTAATCCTACCAGACCG
GTTAAAAGTGGCCAAGACATACAACTTTGAAAAAACATCGAAAGAAAAATCGAAATACAAAATATTTTCT
TCA
|
| Protein Information |
|
Protein Name |
hypothetical protein |
|
NCBI Protein GI |
45656362
|
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Protein Accession |
YP_000448 |
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Protein pI |
7.03 |
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Protein Weight |
190366.08 |
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Protein Length |
1890 |
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Protein Note |
Big; identified by sequence similarity; ORF located using Blastx/Glimmer |
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Protein Sequence |
>YP_000448.1 hypothetical protein LIC10464 [Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130]
MKKIFCISIFLSMFFQSCMSWPLLTGLVGLTAGKKSNGLSFFHLLLGNFNPTITRIELSYQDSSIANGTS
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QKFTAIGIFTDNSKKDITDQVTWNSSSAIVSVSNLDNNKGLGKTNSVGNTTITATLGKVSGNTWFTVVPA
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SPIPITVTDLKLKSITISPSSSSIAKGLTQQFKAIGTFIDGSEQEITNLVTWYSSKSDVAPINNAANAKG
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ENGIQIWRTNLENPGSSSHNWEPIGIGGLRDVTNRQIYSAISGMNFGVNFVYISVGNKNKPVKIYRQQNQ
|
| Epitope Information |
| IEDB Linear Epitope |
|
| IEDB ID |
Epitope |
Starting position |
Ending position |
| 155334 |
PADSS |
1313 |
1318 |
| 51710 |
QNITDL |
85 |
91 |
| 613494 |
SNAQKNQGNA |
543 |
553 |
|
|
|
MKKIFCISIFLSMFFQSCMSWPLLTGLVGLTAGKKSNGLSFFHLLLGNFNPTITRIELSYQDSSIANGTSTTLEVTAIFDNGTNQNITDLTSIVPDSQSVVTIEGNRVKGIASGSSIIKAEYNGLYSEQKITVTPAILNSIQVTSLESGILPKGTNRQFSAIGIFSDGSHQDISNEPLIVWSSSNPDLVRVDDSGLASGINLGTAHIRASFQSKQGAEEMTVGDAVLSQIQVTSNDLNIPLGKKQKLTATGIYSDNSNRDISSSVIWNSSNSTIANIQNNGILETADTGIVTVSASSENIIGSVKLIVTPAALVSISVSPTNSTVAKGLQENFKATGIFTDNSNSDITDQVTWDSSNTDILSISNASDSHGLASTLNQGNVKVTASIGGIQGSTDFKVTQAALTSIEVSPTRTSIAKGLTQKFTAIGIFTDNSKKDITDQVTWNSSSAIVSVSNLDNNKGLGKTNSVGNTTITATLGKVSGNTWFTVVPAVLTSIQINPVNPSLAKGLTQKFTATGIYSDNSNKDITSAVTWFSSDSSIATISNAQKNQGNAYGAATGATDIKATFGKVSSPVSTLSVTAAKLVEIQITPAAASKAKGLTERFKATGIFTDNSNSDITNQVTWNSSNTDIAEIKNTSGSKGITNTLTPGSSEISAALGSIKSSKVILKVTPAQLISIAVTPINPSVAKGLIRQFKATGTYTDHSVQDVTALATWSSSNPGKAMVNNVTGSVTTVATGNTNIKATIDSISGSSVLNVTPALLTSIEITPTINSITHGLTKQFKATGIFSDKSTQNLTQLVTWISSDPSKIEIENTSGKKGIATASKLGSSNIKAVYKFIQSSPIPITVTDLKLKSITISPSSSSIAKGLTQQFKAIGTFIDGSEQEITNLVTWYSSKSDVAPINNAANAKGLATALSIGSSNISAIYNSISSNKINFNVSAATLDSIKINPVNNNIAKGLTQQYTALGVYSDSTIQDISDSVTWSSSNSDSISISNSTETKGKATALQIGNSKITATYNSISENIDITVSAATLSSISISPINTNINATVSKQFFAVGTYSDGTKADLTSSVTWSSSNKSQAKVSNASKTKGLVTGIASGNSIITATYGSVSGNTILTVNKTDTIAPTVQSVVSLSPTTIQVVYSESINNKEALDLSNYKIIDSSNFIGHCSDNTDFNSNSQTADFSLSSIKGSKNTFTITLSHSQILNKSYTLVVNKQGIHDLSSIPNSLSCPNNSDFIGKEQLKLTSAVCNSLNQVIVSFSKPLYSGKEATKSVECSNPSQCESRYKFAGVSSLGSITSVRILDGKVCGGAPADSSKICLTHSLLQSGGQYTIIAANDLNGDGFDNKSWGAIRDSFDQENLQSSPKDRINFIGCGNSPLNFMDGPIMSDPFGDGSDFGFLVDYNNQIYLGPNVKGNQAARFNYDGTFPESIFFSFTKDINADNRASSRDGGIPVPNYVTIGHTGCTLNSADITTGCGPDNEDGRGVFAIGSLNKKSHIFIAGSRPRRFDYLYYSSDTDTNLNFKYIDMGEITGTATAGTSSIAVIDDRIHVGFAKKNKNLNAPDFGKITFNTSDQNRCAAGNNCDASDGYRGNRFRIDRMPYFGGLSVEDADNYETYTSDNSSINWGYYVGIDSLFVFKEKLYAANGGFPNSLHNGSIIHSTSANPSPCEGSNRCSSWKDTAPRSNPKWHNSPHNNWFSLELTKYRNLIPADKAFSQFAEFNGRLYVTRTICVTKEDHSGLRQSLQTVEGCTDGSYTNRRPQLWKCDPTLTGDTTTCEAEDWSLVGDNGTGFTNFGDNSNHSMTMMVASGSYLYIGFDNENGIQIWRTNLENPGSSSHNWEPIGIGGLRDVTNRQIYSAISGMNFGVNFVYISVGNKNKPVKIYRQQNQ
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