Ifi47 |
| General Information |
| Protegen ID |
3561 |
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Sequence Strain (Species/Organism) |
Mus musculus |
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Taxonomy ID |
10090
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Molecule Role |
Protective antigen |
| Related Vaccines(s) |
RE
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| References |
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| Gene Information |
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Gene Name |
Ifi47 |
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NCBI Gene ID |
15953
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Genbank Accession |
AL645688 |
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Chromosome No |
11 |
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Gene Starting Position |
49076586 |
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Gene Ending Position |
49096986 |
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DNA Sequence |
>NC_000077.6:49076586-49096986 Mus musculus strain C57BL/6J chromosome 11, GRCm38.p4 C57BL/6J
CCTCTGAGAGCACTGTGGCTCATCTTCCCTGACCCTTGCACTGCATTTTGATGAGAAGCGTTTCCTCCAT
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AAAAAGTTTGTAATAACAAGATGAGACTTAG
|
| Protein Information |
|
Protein Name |
transcript variant 3 |
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NCBI Protein GI |
410991938
|
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Protein Accession |
NP_001258605 |
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Protein pI |
6.72 |
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Protein Weight |
44799.2 |
|
Protein Length |
420 |
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Protein Note |
Also known as Igrd; Irgd; 47kDa; Iigp4; Iipg4; IRG-47; Ifggc1 |
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Protein Sequence |
>NP_001258605.1 interferon gamma inducible protein 47 [Mus musculus]
MDQFISAFLKGASENSFQQLAKEFLPQYSALISKAGGMLSPETLTGIHKALQEGNLSDVMIQIQKAISAA
ENAILEVAVIGQSGTGKSSFINALRGLGHEADESADVGTVETTMCKTPYQHPKYPKVIFWDLPGTGTPNF
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HFLREKIWLEALKSAAVSFIPFMTFFKGFDLPEQEQCLKDYRSYFGLDDQSIKEIAEKLGAPLADIKGEL
KCLDFWSLVKDNSIIAQATSAAEAFCAVKGGPESSAFQALKVYYRRTQFLNIVVDDAKHLLRKIETVNVA
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| Epitope Information |
| IEDB Linear Epitope |
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| IEDB ID |
Epitope |
MHC restriction |
Starting position |
Ending position |
| IEDB ID |
Epitope |
Starting position |
Ending position |
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MDQFISAFLKGASENSFQQLAKEFLPQYSALISKAGGMLSPETLTGIHKALQEGNLSDVMIQIQKAISAAENAILEVAVIGQSGTGKSSFINALRGLGHEADESADVGTVETTMCKTPYQHPKYPKVIFWDLPGTGTPNFHADAYLDQVGFANYDFFIIISSSRFSLNDALLAQKIKDAGKKFYFVRTKVDSDLYNEQKAKPIAFKKEKVLQQIRDYCVTNLIKTGVTEPCIFLISNLDLGAFDFPKLEETLLKELPGHKRHMFALLLPNISDASIELKKHFLREKIWLEALKSAAVSFIPFMTFFKGFDLPEQEQCLKDYRSYFGLDDQSIKEIAEKLGAPLADIKGELKCLDFWSLVKDNSIIAQATSAAEAFCAVKGGPESSAFQALKVYYRRTQFLNIVVDDAKHLLRKIETVNVA
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